2004年12月16日，根据水利部办公厅《关于开展2003～2004年度水文水资源调查评价资质年检抽查工作的通知》（办水文[2004]165号）要求，由长江委建管局、设计院、水文局等单位组成的检查组，对长江流域水环境监测中心2003～2004年度水文水资源调查评价甲级资质进行了年度检查。

检查中，专家们认真听取了长江流域水环境监测中心的自查工作汇报，仔细查阅了相关材料，抽查了2003～2004年长江流域水环境监测中心编制完成的各类成果报告。专家组认为长江流域水环境监测中心能够严格按照资质管理办法开展工作，一致同意通过本次资质审查。